Závěrečná zpráva grantu 127/2002/B-BIO/PřF

Název projektu:Analýza 3' konců mRNA přepisovaných z cytoplasmatických kvasinkových plasmidů - využití pro studium iniciace translace u eukaryot.
Hlavní řešitel:RNDr. Martin Pospíšek, Ph.D.
Spoluřešitelé: Mgr. Václav Vopálenský; Mgr. Tomáš Mašek; Mgr. Martin Mokrejš; Jakub Friedl; Michaela Mošovská; Martina Pejznochová; Petra Sekyrová; Lukáš Stibůrek; Blanka Vicenová
Období řešení:2002-2003
Celková dotace:475 tis. Kč

Souhrn výsledků

Mezi nejvýznamnější dosažené výsledky patří příprava nových rhó-0 kmenů kvasinky S. cerevisiae obsahujících zároveň mutace v genech SKI2,3,4,6,8, XRN1, respektive termosensitivní alely abd1ts a ceg1ts. Byla zvládnuta metoda tvorby nových rekombinantních lineárních cytoplasmatických plasmidů rekombinací in vivo a byly vytvořeny nové pGKL plasmidy. Podařilo se naklonovat UTR oblasti transkriptů několika genů pGKL plasmidů a probíhá jejich charakterizace. Dosažené výsledky byly publikovány na 3 mezinárodních konferencích formou 5 posterů, respektive přednášek a zároveň ve sbornících z těchto konferencí. Výsledky byly zpracovány ve 3 diplomových pracích, z nichž 1 byla obhájena v roce 2003 a 2 budou obhajovány v roce 2004. Dosažené výsledky jsou zároveň dobrým základem pro další práci na poli výzkumu posttranskripčních úprav a regulace translace u eukaryot. S pomocí tohoto projektu jsme též za široké účasti našich studentů zorganizovali 25.9.2003 jednodenní "workshop" s názvem RNA klub, kterého se zúčastnilo přibližně 50 převážně českých a slovenských vědců.

Seznam publikací:

Vopálenský V, Pospíšek M (2002) Production of selected proteins encoded by linear pGKL plasmid of the yeast Kluyveromyces lactis in a various expression systems. XVth Meeting on the Biology of Kluyveromyces 6.-8.9.2002, Smolenice, Slovakia
Masek T, Svobodova M, Sunnerhagen P, Pospisek M (2003) Examination of proteosynthesis and mRNA stability in yeast strains with impaired 5'-cap synthesis. 8th Annual Meeting of the RNA Society, July 1-6th, 2003, Vienna, Austria
Sekyrova P, Vopalensky V, Pospisek M (2003) Protein ensemble of yeast linear plasmids. XXIth YGM Conference, July 7-12th, 2003, Göteborg, Sweden
Vopalensky V, Pospisek M (2003) 5' end formation of the linear plasmid mRNAs. XXIth YGM Conference, July 7-12th, 2003, Göteborg, Sweden
Pejznochova M, Vopalensky V, Pospisek M (2003) Cytoplasmic helicase encoded by pGKL plasmids. XXIth YGM Conference, July 7-12th, 2003, Göteborg, Sweden
Mašek T., Vopálenský V., Sunnerhagen P., Pospíšek M. (2003) Analýza polyzomálních profilů. RNA klub, 25.9.2003, Praha, ČR
Vopálenský V., Pospíšek M., (2003) Syntéza 5’ čepičky v kvasinkové cytoplasmě. RNA klub, 25.9.2003, Praha, ČR

Diplomní práce: Lukáš Stibůrek, Petra Sekyrová, Martina Pejznochová