Studium analogů cisplatiny pomocí ab initio kvantově-chemických metod
Hlavní řešitel:
Mgr. Michal Zeizinger
Spoluřešitelé:
Doc.RNDr.Ing. Jaroslav Burda, CSc.
Období řešení:
2002-2003
Celková dotace:
180 tis. Kč
Souhrn výsledků
Cisplatina , nejpoužívanějšího cytostatika např. pro rakovinu vaječníků a varlat, a její analogy jsou studovány v mnoha předních laboratořích účelem získaní platinového léčiva s příznivějšími vedlejšími účinky.
Za dobu trvání grantu (2 roky) byly publikovány tři původní vědecké práce v mezinárodních odborných časopisech. V první práci [1] šlo o stanovení závislosti mezi N1 a H1 deprotonizačních energií a bázového párování modifikovaných guaninů. Druhá práce [2] se zabývala studiem hydratačního chování cisplatiny, kdy dochází k aktivaci tohoto léčiva, odštěpením chlorů a jejich nahrazením za vodu či OH včetně jejich tranzitních stavů. Takto aktivovaná cisDDP dále interaguje s DNA a vzniklé intrastand bridge získané navázáním cisDDP na N7 pozice purinových bazí byly dále zkoumány v třetí práci [3] . Zde byl zahrnut i vliv cukrofosfátového řetězce spojující obě báze a získané (dooptimalizované) struktury byly porovnány s experimentálními RTG daty.
Získané výsledcích byly dále prezentovány formou posterů na konferencích a workshopech, z domácích se jednalo o poster Interaction cisDDP with Bases of DNA na 2. Setkání strukturních biologů v Nových Hradech a z zahraničních šlo o poster Ab initio Study of Cisplatin Analog's na 11. ročníku CCMSI (Conference of Current Trends in Computational Chemistry), dále o poster Effect of sugar-phosphate backbone on platinum(II) bridged DNA purine bases na mezinárodním workshopu Modeling Interaction in Biomolecules a dva postery The influence of N7 Guanine Modification on the Strength of Watson-Crick Base Pairing and Guanine N1 Activity: Comparison of Gas Phase and Condensed Phase Trends a Activation Barriers and Rate Constants of Hydratation of Platinum and Palladium Plane Square Complexes: An ab initio Study na 12. ročníku CCMSI.
Další výsledky jsou ještě připravovány k publikaci v průběhu roku 2004.
Všechny zmíněné publikace mají uvedeno v části acknowlidgement uvedeno, že vznikly za podpory GAUK č. 259/2002/B FYZ/MFF.
Publikace:
[1] The influence of N-7 guanine modifications on the strength of Watson-Crick base pairing and guanine N-1 acidity: Comparison of gas-phase and condensed-phase trends, Burda JV, Sponer J, Hrabakova J, Zeizinger M, Leszczynski J, J Phys. Chem. B, 107 (22): 5349-5356 [2] Activation barriers and rate constants for hydration of platinum and palladium square-planar complexes: An ab initio study, Burda JV, Zeizinger M, Leszczynski J, J Chem. Phys, 120 (3): 1253-1262 [3] The influence of sugar-phosphate backbone on the cisplatin bridged BpB' models of the DNA purine bases. Quantum chemical calculations of the Pt(II) bonding characteristics,Burda JV, Zeizinger M, Leszczynski J, Phys.Chem. Chem. Phys., 2004